Особенностью кулера для корпуса Noctua NF-S12A PWM является возможность управления скоростью с помощью ШИМ при работе от стандартного четырех-контактного разъёма, реализованная силами фирменной микросхемы Noctua NE-FD1. Вентилятор помещен в пластиковую рамку, снабжен антивибрационными прокладками и оборудован самостабилизирующимся масляным подшипником (SSO2), рассчитанным в среднем на 150000 часов безотказной работы. На семи лопастях крыльчатки присутствуют особые наплывы Anti-Stall Knobs, которые должны препятствовать остановке вентилятора при функционировании на малых оборотах. Максимальная скорость вращения составляет 1200 оборотов в минуту при уровне шума 17.8 дБ.